15  红麻与黄麻单倍体的诱导及外源基因导入 

                国际黄麻组织                 1999-2000        陆瑞菊   

16  植物生物反应器   

                  市科委                       1999-2002        姚泉洪沈允刚*      

17  利用反义RNA技术提高油菜的饱和脂肪酸含量 

                市科委                       1999-2003       张大兵       

18  VHb基因转入甘蓝的研究   

                市科委                       1999-2002        李贤姚泉洪        

19  通过反义串联基因转化培育耐贮的番茄品种 

                市农委                       1999-2002    姚泉洪朱为民*  

20  彩色海芋、文心兰、人参果三种高档花卉规模化生产关键技术的研究 

        市科委              1999-2002        周学青*陆瑞菊  

21  油菜单倍体细胞的遗传转化体系建立与应用 

                  市科委(专项)                  1999~2003       黄剑华陆瑞菊    

22  多基因转化培育优质、高产的转基因水稻  

                   国家科委                     2000-2003.    黄健秋*姚泉洪

23  主要转基因农作物标准检测技术研究   

                   市科委                       2000-2002        张大兵陈家华*  

24  进口高档杜鹃规模化克隆生产体系的建立 

                院科发                       2000-2002        孙月芳       

25  花培大麦新品种和品系的示范与推广 

                  院科发                       2000-2002        陆瑞菊黄剑华    

26  利用SCAR法建立杂交粳稻亲本DNA指纹图谱  

                  市农科院青年科技基金         2000-2002    潘爱虎       

27  利用双链RNA技术研究水稻生长发育相关的蛋白激酶基因的功能

           中科院植物分子遗传学        国家重点实验室               2000-2002       梁婉琪  
28  利用转基因植物表达动物细菌性疫苗   

                     市农科院青年科技基金         2000-2002        梁婉琪       

29  利用基因工程创建“黑色玫瑰”新种质    

                                   市农委(育种专项)             2001~2004    彭日荷

30  GUS标记基因的分子进化 

                   院青年基金、实验室                     2001~2003    熊爱生      

31  优质、高产花培大麦“花30”的区试和生产试验及示范  

                   科技部(成果转化)             2001~2004        黄剑华       

32  玉米DH育种技术平台的构建及育种上的应用  

                市科委                      2001~2004   黄剑华       

33  名贵中药霍山石斛细胞再生物的诱导及其规模化培养  

                  市科委                      2001~2004   王亦菲       

34  利用细胞工程培育啤用/保健大麦新品系     

                  市农委(育种专项)            2001~2004   陆瑞菊           

35  新型人乙肝表面抗原基因在植物中高效表达研究 

                  市科委(启明星)               2001-2003      张大兵         

36  EPSPS基因的克隆、表达、抗体制备及其快速检测技术研究 

                  市农委                      2001-2003       张大兵         

37  转基因农产品检测试剂盒中试   

                  科技部 (成果转化)                        2001-2003     张大兵       

38  转多基因水稻优质、高产新品种的培育  

                  国家“863”                 2002~2005   姚泉洪   

39  转基因农作物及其产品中外源基因和及其表达产物检测技术研究 

                  国家“863”                 2002~2004   张大兵   

40  转基因植物中外源基因插入引发非预期效应的分子基础研究  

                  “国家973”                   2002~2006   张大兵   

41  农业转基因农生物检测技术研究  

                  市农委（科技兴农）               2002~2004       张大兵     

42  转基因农产品检测相关的定量快速检测设备的引进  

         市农委（引进、消化、吸收项目） 2002     张大兵   

43  利用单倍体细胞工程创造耐热青花菜新种质  

           市科委                       2002~2005  陆瑞菊   

44  转基因植物表达动物细菌性致病菌抗原基因簇的研究

     院青年基金                   2002-2004    梁琬琪   

45转基因棉花、油菜和水稻中外源基因拷贝数实时荧光PCR快速检测研究 

                  国家自然科学基金             2003~2006    张大兵   

46  转基因大豆、玉米、棉花、油菜和水稻中外源基因拷贝数高通量、快速检测技术研究

                  国家转基因专项               2003~2005   张大兵   

47  主要转基因农产品定量、快速检测技术研究 

                  市科委                            2003~2006   潘爱虎   

48  利用标准分子定量检测转基因油菜

         院青年实验室基金             2003~2005    潘爱虎   

49  核不育油菜恢复基因分子标记研究 

       市农委(科技兴农)             2003~2006    张大兵   

50   转基因作物田间试验基地建设

          市科委                       2003~2006    顾晓君张大兵  

51  动物源性食品、饲料和饮水中精神类药品的检测技术研究

        市科委                             2003~2004    张大兵   

52  水稻结合蛋白基因的克隆及功能研究  

                  院青年实验室基金             2003~2005    熊爱生   

53  新型、可诱导叶绿体表达系统的建立      

               市科委                             2003~2006    贾军伟   

54  基因沉默的分子基础研究 

        市科委                             2003~2006    梁婉琪   

55  植物细胞工程育种示范基地的建设 

       院推广基金                   2003~2004   黄剑华   

56  苹果砧木三价基因遗传转化体系的建立与种质创新   

     国家自然科学基金             2003~2006    彭日荷   

57  转基因植物安全体系研究 

       市科委                             2003~2006  姚泉洪    

58  植酸酶基因家族改组及体外定向分子进化 

              国家自然科学基金             2004~2007   姚泉洪   

59  优质高产大麦“花30”在豫、鄂、闽的中试与示范    

         市科委                       2004~2006   黄剑华   

60  β-葡萄糖苷酸基因改组及同源比较建模     

           市自然科学基金               2004~2007   熊爱生   

61  转基因抗除草剂油菜T45品系特异性PCR检测技术研究    

                   市科委                       2004~2006   潘爱虎   

62  贯叶连翘遗传改良新途径     

              院发基金                     2004~2006   王亦菲   

63  DH大麦新品种、新品系在盐城的示范与推广  

             院推广                       2004~2005   黄剑华   

64  美科能磁化水装置在农业上应用   

                  企业                    2004~2004   韩佩来   

65  水稻和重要绿化植物功能基因安全利用与技术平台研究

        市科委                      2003-2006   姚泉洪

66  转基因抗除草剂油菜OXY235定性定量PCR检测技术研究

      市科委                      2005-2007   潘爱虎

67  重要报告基因的体外分子进化研究 

     市科委启明星                2005-2007   熊爱生

68  耐高温中性植酸酶产业化 

     市科委创新                  2005-2007   姚泉洪

69  耐高温中性植酸酶产业化 

     科技部创新                  2005-2007   姚泉洪

70  水稻抗旱转录调控网络研究  

              科委重大项目子课题          2005-2007   姚泉洪

71  水稻DREB类抗逆有关转录因子的调控网络研究  

              国际合作                    2005-2007   姚泉洪

72  水稻抗冻有关转录因子DREBIs/ CBFs的调控网络研究

           市科委                      2005-2007   彭日荷-

73  利用单倍体细胞工程培育大麦抗赤霉病新种质   

                市科委                      2005-2006   黄剑华

74  蜡梅种质资源收集、评价与利用研究  

                  科技兴农                    2005-2008   陆瑞菊

75  大麦花药/小孢子水平的 耐赤霉病和耐盐碱性鉴定   

                   院发基金                   2005-2006   孙月芳

76  油菜二倍体与单倍体水平的耐盐性研究   

                  市自然科学基金              2005-2007   王亦菲

77  春兰种质评价与杂交、繁殖关键技术的研究  

                   科技兴农                    2005-2006   王亦菲

78  转基因玉米MON863品系特异性检测 

       院人才基金                 2005-2007   赵  凯

79  基于S’端转基因整合序列的抗虫玉米BT176品系特异性检测 

                  青年科技基金               2006-2008   孙建萍

80  通过体外分子进化获得新型安全的抗草甘膦除草剂基因  

                  院发基金                   2006-2007   熊爱生

81  土壤污染修复的转基因植物研究  

            科委基金处人才计划         2006-2008   姚泉洪       

82  一氧化氮合成酶基因与植物干旱抗性的相关性研究  

             市自然基金                   2006-2008   彭日荷

83  一氧化氮参与植物干旱抗性的调控机理研究

                     国际自然基金                2007-2009   姚泉洪