SLAF-Based linkage map construction and QTL mapping of nitrogen use efficiency in rice (Oryza sativa L.)

氮素是植物生长发育所需的大量元素之一，水稻是我国的主要粮食作物，水稻生产对氮的需求仅次于水，是构成水稻生长成本的主要部分。目前，水稻氮肥表观利用率只有39%，即施氮肥量的50%以上残留在环境中。因此，在保证产量不减的基础上如何提高氮肥的利用效率，减少氮肥的使用量是我国农业可持续发展亟待解决的重要问题。

本研究以水稻品种Nipponbare和OM052为亲本，构建159个F3代的重组自交系群体，分别在高氮和低氮种植条件下对水稻氮肥利用效率(nitrogen use efficiency, NUE)以及农业NUE和籽粒氮增长率（GIR）进行QTL定位，并筛选分子标记以辅助育种。

本研究利用SLAF-seq技术筛选得到2707个标记，构建了一个高密度连锁图谱，QTL分析后发现4个重要QTL与NUE紧密先关，分别分布在第1、6、7号染色体上，贡献率在2.96%至11.11%之间，LOD值在2.5至3.75。根据QTL定位结果，对性状候选区域内的基因进行了功能注释。本研究为水稻氮肥高效利用以及后续的育种工作提供了理论依据。