随着大数据时代的到来，低成本、高效率、智能化、高精度的数据采集和解析技术和方法是表型组学研究中的重要内容，将为育种工作带来更高的育种效率，并可节省大量的人力、物力成本，进而更快推动基因组学发展。

  采用Visual Studio 2010开发平台，基于C++语言和OpenGL图形API开发的具有自主知识产权的“植物骨架获取与三维可视化软件”是一款用于获取植物三维形态结构参数的专用软件。该软件与“三维数字化仪”搭配，可实现器官大小、方位朝向、夹角等多种形态参数快速获取。测量速度快、精度高，大大提升了数据获取速度和数据质量。同时，还拥有三维重建、交互设计、冠层分析等功能，是植物表型学研究的重要支撑工具。

  自2017年至今，“植物骨架获取与三维可视化软件”在国家设施农业工程技术研究中心、上海交通大学、孙桥现代农业园区等多地开展了应用研究。已开展了基于三维植物结构模型的光环境模块搭建及冠层光截获模拟运算、结构模型与FvCB光合模型耦合、结构模型与同化物积累和分配模型的互反馈机制研究，开展了包括冠层光分布异质性特征分析、冬季弱光条件下最优化栽培密度虚拟试验等应用研究。也在黄瓜株型相关基因挖掘相关合作研究中得到应用。利用该方法获取到的器官尺度表型参数如叶片大小、叶柄长度、节间长度、侧枝长度、夹角等形态参数，可与全基因组分子标记进行关联分析，解决了传统形态参数调查方法工作量大、参数种类不全面的限制，促进了植物株型相关基因的挖掘和关联分析。

  目前针对该技术已授权的具有自主知识产权的发明专利2项，软件著作权2件，完成成果转化16万元。