Gene & Genomics在线发表我院玉米团队研究论文
2020年7月16日,我院CIMMYT-中国特用玉米研究中心郑洪建团队于 Gene & Genomics在线发表题为“The dynamic transcriptome of waxy maize (Zea mays L. sinensis Kulesh) during seed development”的研究论文。
玉米的经济价值和营养价值主要体现在玉米籽粒上,对玉米籽粒的研究尤为重要。玉米籽粒发育过程中基因表达与生理功能密切相关,目前人们对影响籽粒发育的重要基因仍然所知有限,大部分参与籽粒发育过程的基因的表达和功能等信息仍然不清楚,尤其在糯玉米籽粒发育过程中的基因表达调控信息,我们知之甚少。
本研究以课题组育成的糯玉米自交系SWL01为实验材料,分析授粉后6个时期的籽粒转录组数据,共鉴定到24546个基因表达,其中有1611个基因是转录因子。同时发现2457个基因 (包括177个转录因子) 在糯玉米籽粒中特异表达。通过对各发育时期籽粒特异表达基因进行功能富集分析,阐述了籽粒特异表达基因在各发育时期参与的生物学调控过程。最后,通过与普通玉米自交系B73籽粒转录组数据比对分析,鉴定到有113个差异表达基因参与到籽粒发育的调控过程,推测113个基因可能是糯玉米籽粒发育的关键基因。总体而言,该项研究阐述了糯玉米籽粒发育过程中表达基因的动态表达谱,鉴定到一系列与糯玉米籽粒发育相关的基因,这些将为糯玉米籽粒发育的功能研究提供数据资源,并为糯玉米分子标记辅助育种提供支撑。
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