作物所玉米研究中心郑洪建团队在Plant Molecular Biology Reporter发表了题为“Genome-wide Comparative Analysis of Genetic Diversity of Regular and Specialty Maize Germplasms through Genotyping by Target Sequencing (GBTS)”的文章。

特用玉米用途广泛，对常规和特用玉米种质进行全基因组比较非常重要。在本研究中，使用基于液相探针杂交的靶向基因捕获技术（GBTS）方法进行基因分型共生成了20,000个 单核苷酸多态性（SNP）标记，其中18,497个高质量SNP用于探索常规玉米（163）和特用玉米（124）的群体结构和遗传多样性玉米资源。邻域连接聚类分析将287个测试的玉米种质分为三个主要组，其中爆裂玉米和其他类型的玉米种质聚类为不同的组。普通温带玉米进一步分为五个杂优势亚群，而糯玉米和普通热带玉米又分为两个独立的亚群。然而，优质蛋白玉米（QPM）无法与普通热带玉米区分开来。爆裂玉米和糯玉米之间的等位基因频率差异最大（P<0.05）（28.2%），爆裂玉米和普通热带玉米之间的等位基因频率差异为26.0%，爆米花和普通温带玉米之间的的等位基因频率差异为25.4%。

本研究中产生的信息有助于将已鉴定的遗传变异引入杂交育种计划，以改进特用玉米的农艺性状，也有助于对特用玉米进行全基因组关联作图。通过本研究也证明GBTS平台产生的高质量分子标记可用于不同玉米种质资源（包括爆米花和糯玉米）的基因型鉴定。