动物健康养殖重点学科成立于2007年9月，主要从事动物健康养殖基础理论研究和应用技术的推广，旨在促进我国养殖业的健康持续发展，从源头上解决动物食品安全问题，为我国和上海的畜牧业健康持续发展提供技术支撑。学科设四个研究方向：动物种质资源的保护和开发、动物健康营养调控、动物健康与生态环境控制、畜禽养殖疾病预警与防控。动物健康养殖学科设首席科学家1人，学科带头人4人，具有博士学位的科技人员8人，科技人员共20 人。