全所现有在职职工81人，其中具有正高职称14人，占比17.3%。副高职称35人，占比43.2%，具有硕士以上学历人数占比90.1%，其中博士学位49人，占比60.5，40岁以下青年科技骨干45人，占比56%。

全所拥有国务院政府特殊津贴、上海市领军人才、上海市“引进海外高层次人才计划”、上海市优秀技术带头人、上海市浦江人才计划、上海市农业领军人才、闵行区领军人才、奉贤区“滨海贤人”领军人才等高层次专家人才称号9人次，国家产业技术体系综合试验站站长1名。全所共有6人获得上海市“启明星”计划支持，13人获得上海市“扬帆”计划支持，25人获得“上海市市级农口系统青年人才成长计划”和“上海市科技兴农技术培育项目”支持。

全所共有3个团队“A类团队-农田障碍土壤研究团队”、“B类团队-有益生物利用与有害生物防控创新团队”以及“新兴学科团队-水产养殖废水综合处理团队”入选上海农业科学院第二轮“卓越团队”建设计划（2022-2026年）。

与上海海洋大学、浙江农林大学、湖南农业大学、山西农业大学、上海师范大学、安徽师范大学、上海应用技术大学、长江大学、淮阴工学院、安顺学院等十余所国内科研院校开展研究生和本科生联合培养工作，拥有兼职博士生导师1名、硕士生导师11人。